Die IHK - Ausbildung ist eine auf drei Jahre angelegte duale Ausbildung, darum findet die Ausbildung zum Teil im Betrieb und zum Teil in der Berufsschule statt. Die Schulen vermitteln das nötige Wissen für den Beruf und im Betrieb kann dieses Wissen dann praktisch umgesetzt werden.

Während einer IHK - Ausbildung muss eine Zwischenprüfung sowie eine schriftliche und eine mündliche Abschlussprüfung abgelegt werden. Diese Prüfungen werden zentral von der IHK gestellt und abgenommen.

Die Berufsausbildung zum Fachinformatiker kann auch in Kombination mit einem Studium an einer Fachhochschule absolviert werden. Es handelt sich dabei um so genannte "duale Studiengänge", die jedoch nicht mit dem Modell der Berufsakademie zu verwechseln sind.

Jeder angehender Fachinformatiker muss sich zwischen den Fachrichtungen Anwendungsentwicklung und Systemintegration entscheiden.